Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MS4A2Q01362 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms