Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG7P83436 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG7P83436 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG7P83436 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG7P83436 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG7P83436 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG7P83436 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG7P83436 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG7P83436 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG7P83436 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms