Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms