Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFI35P80217 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFI35P80217 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFI35P80217 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFI35P80217 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFI35P80217 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFI35P80217 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFI35P80217 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFI35P80217 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFI35P80217 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFI35P80217 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFI35P80217 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFI35P80217 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFI35P80217 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IFI35P80217 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
IFI35P80217 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IFI35P80217 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFI35P80217 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFI35P80217 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFI35P80217 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFI35P80217 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFI35P80217 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms