Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBA52P62987 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBA52P62987 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBA52P62987 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBA52P62987 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBA52P62987 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBA52P62987 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBA52P62987 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBA52P62987 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBA52P62987 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBA52P62987 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBA52P62987 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBA52P62987 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBA52P62987 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UBA52P62987 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBA52P62987 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBA52P62987 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms