Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL23P62829 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL23P62829 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL23P62829 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL23P62829 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL23P62829 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL23P62829 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL23P62829 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL23P62829 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL23P62829 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL23P62829 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL23P62829 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL23P62829 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL23P62829 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL23P62829 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL23P62829 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL23P62829 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL23P62829 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL23P62829 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL23P62829 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL23P62829 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL23P62829 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL23P62829 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL23P62829 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL23P62829 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms