Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA9P57773 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA9P57773 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA9P57773 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA9P57773 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA9P57773 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA9P57773 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA9P57773 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA9P57773 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA9P57773 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA9P57773 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA9P57773 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA9P57773 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA9P57773 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA9P57773 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA9P57773 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA9P57773 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA9P57773 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA9P57773 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA9P57773 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA9P57773 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA9P57773 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms