Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms