Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB25P57735 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB25P57735 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB25P57735 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB25P57735 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB25P57735 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB25P57735 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB25P57735 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB25P57735 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB25P57735 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB25P57735 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB25P57735 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB25P57735 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB25P57735 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB25P57735 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB25P57735 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB25P57735 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB25P57735 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB25P57735 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB25P57735 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB25P57735 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB25P57735 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB25P57735 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB25P57735 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB25P57735 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms