Protein–RNA interactions for Protein: P53189

SCW11, Probable family 17 glucosidase SCW11, yeast

Predictions only

Length 542 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW11	P53189	YCF1	YDR135C	4548 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	DPH6	YLR143W	2058 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	MSC7	YHR039C	1935 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	SRS2	YJL092W	3525 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	MCM2	YBL023C	2607 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	UBP12	YJL197W	3765 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	IKS1	YJL057C	2004 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	RPS0A	YGR214W	759 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	NKP2	YLR315W	462 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	GAC1	YOR178C	2382 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	MSH4	YFL003C	2637 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	GDE1	YPL110C	3672 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	MET12	YPL023C	1974 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	PEX5	YDR244W	1839 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	KRS1	YDR037W	1776 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	PMC1	YGL006W	3522 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	VAC7	YNL054W	3498 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	TRM44	YPL030W	1704 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	RPS29B	YDL061C	171 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	SRL3	YKR091W	741 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	CCW14	YLR390W-A	717 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	RIA1	YNL163C	3333 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	KIN4	YOR233W	2403 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	YSH1	YLR277C	2340 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	USE1	YGL098W	738 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	GOT1	YMR292W	417 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	SAR1	YPL218W	573 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	AIM21	YIR003W	2040 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	PUT2	YHR037W	1728 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	ROK1	YGL171W	1695 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	ECM15	YBL001C	315 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	KCC4	YCL024W	3114 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SCW11	P53189	YBR259W	YBR259W	2067 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	SIP1	YDR422C	2448 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	HDA3	YPR179C	1968 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	NPC2	YDL046W	522 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	YLR346C	YLR346C	306 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	HHF1	YBR009C	312 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	SEC5	YDR166C	2916 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	ARN1	YHL040C	1884 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	SRB4	YER022W	2064 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	VID30	YGL227W	2877 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	DLS1	YJL065C	504 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	JHD2	YJR119C	2187 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	KEL2	YGR238C	2649 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	PDE2	YOR360C	1581 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	HPC2	YBR215W	1878 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	snR61	snR61	90 nt		4	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	POG1	YIL122W	1056 nt		4	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	YIR030W-A	YIR030W-A	384 nt		4	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	UPS1	YLR193C	528 nt		4	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	SWI3	YJL176C	2478 nt		4	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	SPO21	YOL091W	1830 nt		4	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	ALY1	YKR021W	2748 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	YJL222W-B	YJL222W-B	138 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	NNK1	YKL171W	2787 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	BLM10	YFL007W	6432 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	MBP1	YDL056W	2502 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	KEX1	YGL203C	2190 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	PAU13	YHL046C	363 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	SAE3	YHR079C-A	276 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	NCE101	YJL205C	162 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	YPR092W	YPR092W	306 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	SEN1	YLR430W	6696 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	CDC45	YLR103C	1953 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	DAP2	YHR028C	2457 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	TSA2	YDR453C	591 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	SGF11	YPL047W	300 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	GAL11	YOL051W	3246 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	LCD1	YDR499W	2244 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SCW11	P53189	TPO2	YGR138C	1845 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	YDL041W	YDL041W	354 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	YDR003W-A	YDR003W-A	123 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	RPS18B	YML026C	441 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	VMA1	YDL185W	3216 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	CDC24	YAL041W	2565 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	VID28	YIL017C	2766 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	snR74	snR74	88 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	ISU1	YPL135W	498 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	YPK9	YOR291W	4419 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	YIL166C	YIL166C	1629 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	MNL1	YHR204W	2391 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	MSS11	YMR164C	2277 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	GAL4	YPL248C	2646 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	EBS1	YDR206W	2655 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	VHS3	YOR054C	2025 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	YEL073C	YEL073C	324 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	YGL239C	YGL239C	315 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	LCB5	YLR260W	2064 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	PRM15	YMR278W	1869 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	MNR2	YKL064W	2910 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	GUP1	YGL084C	1683 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	YER077C	YER077C	2067 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	PMP1	YCR024C-A	123 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		3.93	□□□□□ -1.78

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