Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPC3P51654 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPC3P51654 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPC3P51654 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC3P51654 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC3P51654 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC3P51654 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC3P51654 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC3P51654 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC3P51654 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC3P51654 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC3P51654 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC3P51654 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC3P51654 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC3P51654 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC3P51654 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC3P51654 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC3P51654 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC3P51654 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC3P51654 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms