Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV1P50549 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV1P50549 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV1P50549 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV1P50549 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV1P50549 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETV1P50549 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms