Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATMP50440 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATMP50440 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATMP50440 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATMP50440 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATMP50440 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GATMP50440 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATMP50440 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATMP50440 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATMP50440 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GATMP50440 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATMP50440 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATMP50440 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATMP50440 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATMP50440 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATMP50440 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATMP50440 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATMP50440 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms