Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS4P49798 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS4P49798 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS4P49798 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS4P49798 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS4P49798 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS4P49798 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS4P49798 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS4P49798 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS4P49798 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS4P49798 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS4P49798 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGS4P49798 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGS4P49798 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms