Protein–RNA interactions for Protein: P47100

TY1B-JR2, Transposon Ty1-JR2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-JR2P47100 LEU3YLR451W 2661 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 CAT2YML042W 2013 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 YIL082WYIL082W 873 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 SNX4YJL036W 1272 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 HRT3YLR097C 1035 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 YLR140WYLR140W 327 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 SPC29YPL124W 762 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 SRP1YNL189W 1629 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 YGR149WYGR149W 1299 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 YDL050CYDL050C 372 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 AI1Q0050 2505 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 STE24YJR117W 1362 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 YDL186WYDL186W 834 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 YLR053CYLR053C 327 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 snR11snR11 258 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-JR2P47100 YEL075CYEL075C 369 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 MGE1YOR232W 687 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 SHE3YBR130C 1278 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 DXO1YDR370C 1329 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 MAL33YBR297W 1407 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 VMA5YKL080W 1179 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 SMD3YLR147C 306 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YAR075WYAR075W 474 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YBL028CYBL028C 321 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YIL058WYIL058W 285 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 MED11YMR112C 396 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 PCL6YER059W 1263 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 GPN3YLR243W 819 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YIP3YNL044W 531 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 NOP15YNL110C 663 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 DPB3YBR278W 606 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 PDS5YMR076C 3834 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 COS7YDL248W 1152 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 OMA1YKR087C 1038 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YJR029WYJR029W 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YDR124WYDR124W 975 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 HTA1YDR225W 399 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YUH1YJR099W 711 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 RIT1YMR283C 1542 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 STE5YDR103W 2754 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 CTF18YMR078C 2226 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YER119C-AYER119C-A 372 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 FIP1YJR093C 984 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 RSM26YJR101W 801 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 TRM2YKR056W 1920 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YEL028WYEL028W 462 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YGR290WYGR290W 444 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 CAF20YOR276W 486 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YOR314WYOR314W 330 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 RKR1YMR247C 4689 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 PCL9YDL179W 915 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YJL211CYJL211C 444 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 RGM1YMR182C 636 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 GCD2YGR083C 1956 nt0.9□□□□□ -2.26
TY1B-JR2P47100 YGL242CYGL242C 546 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 MMF1YIL051C 438 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 MLH3YPL164C 2148 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 HUL5YGL141W 2733 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 FSH1YHR049W 732 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 MSA2YKR077W 1092 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 UBX4YMR067C 1251 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 YMR144WYMR144W 1029 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 YPL035CYPL035C 348 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 YDR355CYDR355C 303 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 SUI2YJR007W 915 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 RRT15YLR162W-A 189 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 IFH1YLR223C 3258 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 YBL029WYBL029W 1131 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 MRP2YPR166C 348 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 LDH1YBR204C 1128 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 STB4YMR019W 2850 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 TRM12YML005W 1389 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 ZRG8YER033C 3231 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 DAL5YJR152W 1632 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 YDL062WYDL062W 426 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 UBC13YDR092W 462 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 GTR2YGR163W 1026 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 RPA12YJR063W 378 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 AIM36YMR157C 768 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 RNP1YLL046C 750 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 HAP4YKL109W 1665 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 NCL1YBL024W 2055 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 BNA7YDR428C 786 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 YJL169WYJL169W 369 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 CCL1YPR025C 1182 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-JR2P47100 MON1YGL124C 1935 nt0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.7 ms