Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL35P42766 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL35P42766 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL35P42766 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPL35P42766 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms