Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX2P32243 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX2P32243 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX2P32243 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX2P32243 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX2P32243 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX2P32243 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX2P32243 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX2P32243 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX2P32243 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX2P32243 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX2P32243 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX2P32243 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX2P32243 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX2P32243 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX2P32243 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX2P32243 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms