Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFNP31947 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFNP31947 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFNP31947 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFNP31947 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SFNP31947 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFNP31947 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFNP31947 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFNP31947 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFNP31947 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFNP31947 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFNP31947 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFNP31947 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFNP31947 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFNP31947 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFNP31947 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFNP31947 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFNP31947 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFNP31947 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFNP31947 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFNP31947 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFNP31947 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFNP31947 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFNP31947 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFNP31947 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFNP31947 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFNP31947 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFNP31947 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFNP31947 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFNP31947 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFNP31947 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFNP31947 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFNP31947 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFNP31947 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SFNP31947 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFNP31947 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFNP31947 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFNP31947 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFNP31947 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFNP31947 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFNP31947 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFNP31947 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFNP31947 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFNP31947 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms