Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms