Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms