Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF3P20783 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms