Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB1P20700 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms