Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms