Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms