Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GNAT1P11488 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms