Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms