Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms