Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms