Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPBP07199 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPBP07199 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPBP07199 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPBP07199 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPBP07199 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPBP07199 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPBP07199 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPBP07199 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPBP07199 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPBP07199 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPBP07199 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPBP07199 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPBP07199 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPBP07199 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPBP07199 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPBP07199 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPBP07199 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPBP07199 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPBP07199 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPBP07199 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPBP07199 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPBP07199 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPBP07199 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPBP07199 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPBP07199 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPBP07199 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPBP07199 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPBP07199 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPBP07199 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPBP07199 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPBP07199 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPBP07199 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPBP07199 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPBP07199 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPBP07199 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPBP07199 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPBP07199 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPBP07199 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPBP07199 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPBP07199 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPBP07199 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPBP07199 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPBP07199 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPBP07199 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPBP07199 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPBP07199 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPBP07199 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPBP07199 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPBP07199 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPBP07199 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPBP07199 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPBP07199 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPBP07199 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPBP07199 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms