Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-HP01893 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms