Protein–RNA interactions for Protein: P01762

IGHV3-11, Immunoglobulin heavy variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-11P01762 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-11P01762 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms