Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms