Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF4AO95239 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms