Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT7O43581 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT7O43581 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT7O43581 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT7O43581 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT7O43581 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT7O43581 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT7O43581 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT7O43581 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT7O43581 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT7O43581 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT7O43581 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT7O43581 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT7O43581 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms