Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms