Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms