Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XIRP2A4UGR9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms