Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms