Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms