Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms