Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNMT3BQ9UBC3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNMT3BQ9UBC3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNMT3BQ9UBC3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNMT3BQ9UBC3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNMT3BQ9UBC3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNMT3BQ9UBC3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNMT3BQ9UBC3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNMT3BQ9UBC3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNMT3BQ9UBC3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNMT3BQ9UBC3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms