Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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