Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms