Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD3Q9NX63 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms