Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM161AQ9NX61 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms