Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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