Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms