Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms