Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLSPNQ9HAW4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLSPNQ9HAW4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLSPNQ9HAW4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLSPNQ9HAW4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLSPNQ9HAW4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLSPNQ9HAW4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLSPNQ9HAW4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms