Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D4AQ9H788 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms